Vanaf 2016 is het budget voor vervoer van en naar instellingen die JeugdzorgPlus bieden, onderdeel van het gemeentelijk budget. In 2015 werd dit nog door VWS bekostigd. Het is belangrijk dat gemeenten hier bij de inkoop rekening mee te houden.
De instellingen die JeugdzorgPlus bieden, sluiten zelf contracten af met de wettelijk aangewezen vervoerder. Het budget dat daarvoor nodig is, komt niet langer rechtstreeks vanuit VWS, maar moet onderdeel zijn van de contracten tussen gemeenten en de instellingen. In de Inkoophandreiking JeugdzorgPlus staat een verdere toelichting op het per 2016 overgehevelde bedrag. Het gaat om € 2,8 miljoen per jaar. Als in de inkoop met een dagprijs gewerkt wordt, betekent dit € 6,59 euro per dag per plaats.